万历三十一年十月三日，不愿坐以待毙的华侨爆发起义，但由于缺少武器和军事经验，他们仅坚持了四使一天。起义很快演变成一场大屠杀。在当局的煽动和蒙骗下，包括土著、日侨在内的各方力量都参与到屠杀中。据统计，至少人万华侨被
大量屠杀华侨对吕宋本土经济产生致命影响，物资匮乏、经济萧条。当局财政状况恶化，甚至需要借贷度日。
西班牙人忧心中国商船不再到来，会令遥远的美洲受到波及。更大的恐惧是，他们担心明朝政府会进行报复。西菲当局紧急加强战备，但军队士气低落，口粮严重不足。殖民者只能心惊肉跳地等待，马尼拉笼罩在绝望和萧条气氛中。万历三十二年六月，一批对前途悲观的富人离开马尼拉，举家迁往墨西哥。
西班牙驻吕宋总督阿库尼亚一面做些表面工作，如部分发还华侨商人的财产，发动幸存者给国内写信，企图证明西班牙殖民者“清白”；一面派特使奎瓦携带致广东、福建两省巡抚和其他官员的函件，于万历三十一年十二月十日乘船前往澳门，并趁机刺探中国有否进攻吕宋打算的军事情报。考虑到澳门的葡萄牙人对中国比较了解，阿库尼亚还写了几封信，详述华侨起义事件，并附上致中国官员函件的副本，让奎瓦分发给澳门的司令官、主教、在政务方面有着较大发言权的耶稣会教士等。
奎瓦一行因遭遇风暴于当年二月折返马尼拉，二月二十五日又由一百五十名西班牙士兵和一名神父陪同再赴澳门。但葡萄牙人出于打击贸易竞争对手的考虑，始终未将函件转交中国方面。
奎瓦等抵达澳门的消息传到漳州，有经常往来漳州和马尼拉的中国富商到澳门与其会见，答应把函件转交中国官员，设法动员华侨继续贸易。奎瓦在澳门了解到，明朝政府已获悉屠杀事件，但全国平静，没有集结舰只进攻马尼拉的迹象。获此情报后，奎瓦购买了一批军事物资，于五月回到马尼拉。
奎瓦带回的消息令西菲当局忧惧大减，但直至万历三十三年五月，西班牙人望眼欲穿的华商船只仍难觅踪影，相反却从澳门传来消息，中国已经集结一支军队，准备前来兴师问罪，一时间又使西班牙人惊惧不已。事实上，尽管明朝当局了解了事件真相，但它一贯把移民国外的华侨视为贱民，因此仅写了一份《谕吕宋檄》，于万历三十三年五月底、六月初由中国贸易船队中一名船主带到马尼拉，分交吕宋总督、马尼拉最高法院和马尼拉大主教。檄文未对屠杀行为进一步严加追究，只要西班牙殖民当局保证华侨今后生命财产的安全，并宣布对殖民者“不忍加诛”，“其海外戕杀姑不穷治”，要求西班牙方面“当思皇帝浩荡之恩，中国仁义之大”。
明朝未出兵讨伐还有当时现实条件的限制。在西班牙屠杀华人大致同一时期，明王朝进行了三场大规模战争：在西北的宁夏、西南的播州，特别是从万历二十年开始的长达七年与日本在朝鲜进行的战争。这三场大战明朝都获胜，但国家军事和财政损耗极大。
而大明王朝的态度，也让西班牙人松了一口气，并开始坚定的认为无论自己在吕宋对当地华人做了什么事情，大明王朝也都是绝对不会出兵的。
于是便有了这残忍而肆无忌惮的第二次屠杀......
但他们这一次错了，因为这一次他们直接面对的对手是丁云毅！
大明——武烈侯——丁云毅！
此前曾经无数次丁云毅都已经准备对吕宋、爪哇等地动手，但条件却始终不成熟。在内，虎贲卫需要发展；在外，尚有郑芝龙和张肯堂两大势力对自己虎视眈眈。不得不让丁云毅暂时把这个想法按捺了下来。
在局势对丁云毅转向有利之后，远航殖民舰队的出发便是一次丁云毅试探性的进发。
而现在，福建已经在丁云毅的手里了，所有的条件都已经成熟了......
朝那些情绪激动的部下看了眼，丁云毅终于缓缓开口说道：“屠我子民，杀我百姓，是可忍，孰不可忍。诸位，准备出兵吧！”
“是！准备出兵！”所有将领怔了一下，接着轰然应道。
“但是如何打，必须仔细考虑。”丁云毅的脸上却丝毫看不到任何兴奋，反而异常的严峻：“干腊丝人在吕宋经营许久，一切防御完备。我华侨起事，短短时间之内便被平定即是最好证明。我的想法，是要把吕宋之干腊丝舰队引出来打......”
一瞬间，所有的将领都明白了武烈侯的意思。
“‘天使’号现在在哪里？”丁云毅忽然问道。
“回盟主，还在头领海泥熊的的控制之下。”金翅雕急忙上前答道。
“好，立刻让海泥熊全力做好准备，一定要把‘天使’号安然无恙的交到我的手里。”丁云毅略略提高了自己的声音：“秦云，给我挑选一批精明能干的干腊丝水手出来，一定要对我们绝对忠诚的，还有，再仔细挑选一批泰西男人女人，全部给我冒充成‘天使’号上的乘客，对了，还有找一个聪明的领头人，务必要使科库耶拉相信。”
随即，他的目光缓缓的在自己的水军将领身上一一扫过：“我虎贲卫水军，全部做好准备，随即进攻吕宋，这一次一定要把干腊丝人全部从吕宋赶出去！我，将亲自率军征讨吕宋之干腊丝人！”
“愿听武烈侯调遣！”所有将领一齐大声说道。
武烈侯亲自率军出征，这对于虎贲卫的所有人来说都不是什么新鲜事。反而是丁云毅不亲自出征那才是真正奇怪的事情。
“虎贲亲军、虎贲近军全部随军出征。”丁云毅下了这样决心：“还有从我大明军官学院里挑选出一批学员跟随我们一起出征，他们在学校里学了许多知识，但那都是死的，真正战场上的经验是他们在学校里学不到的！”
这一刻的虎贲卫将领们热血沸腾，这一刻的丁云毅也同样是热血沸腾：“我知道一句话，现在我把这句话换一个字送给你们，‘犯我大明着，虽远必诛’！”
犯我大明者，虽远必诛！
那些在吕宋死难的华人们，他们的鲜血是不会白流的！很快，那些曾经肆无忌惮的屠杀过华人的干腊丝人，将会体会到虎贲卫的愤怒！
是虎贲卫的愤怒，也更是整个大明帝国最强最猛烈的愤怒！
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