第二道防线的地理位置没有在慧忠路隧道的第一道防线理想，好在工兵组提前已经于两道防线之间多处安放了炸药，国家体育馆、奥林匹克体育中心游泳馆周围、轮滑广场以及数字博物馆等位置都已经做了安排。
慧忠路隧道的爆破带来了意想不到的效果，前方的情况反馈到邵一夫手中时，邵一夫果断的派出了第三批大概100人左右赶赴地铁15号线奥林匹克公园站处，延15号线地铁轨道安放高bao炸药，这里作为第三道防线，也差不多是最后的防线，地铁过去不到一公里就是清华协和部所在地中科院燕京基因组研究所。
第61889部队的最后100名战士留守研究所，进行着最后的防御准备工作。研究所内囤积的炸药和军火都被分配下去，一点剩余的都没有留下。奥运村科技园区内，一些建筑被临时改造成最后的堡垒，这些堡垒都被改造成全封闭式结构，犹如一个个活棺材。进入堡垒内部的战士，等于是已经放弃了逃生的机会，作为为转移工作争取时间的弃子而留在了里面。
葛从先带来的直升机大队仍在有条不紊得进行着转移工作，整个研究所内已经抽调不出任何一名战士来协助他们。远处战斗的枪声和爆炸声离得越来越近，已经登机的科研人员都为前线的战士捏了一把汗，他们都清楚自己的生命是战士们用自己的牺牲去争取回来的，有的人已经难过地流下了眼泪。
直升机一架架地起飞了，邵一夫和葛从先看着窗外渐渐消失在天际的直升机，两人的心情各不相同。邵一夫的情绪轻松了很多，任务完成了一大半，剩下的工作就是要考虑如何尽可能多的把战士们带出去，直升机大队的运力以及时间因素的限制导致研究所的战斗人员没有登机的机会，邵一夫不想让他们牺牲在这里。
葛从先还在考虑劝说邵一夫随第二批次的直升机撤离，邵一夫的坚持让他比较头大，因为他来之前，曾接到荣云的特别叮嘱，荣云要求他一定要把邵一夫接出来，实在不行可以动用特殊手段。
“看来还是主席更了解老邵啊，”葛从先心里叹了口气，和邵一夫聊了几句后转身离开去做下一步的安排。
邵一夫回头望了眼葛从先的背影，感觉刚才葛从先的神情有些奇怪，想了想之后也没发现什么不对劲的地方。
直升机从慧忠路隧道上方飞过的时候，飞机驾驶员向下方看了看。高bao炸药炸开的深坑中已经填满了密密麻麻的丧尸，隧道南侧的尸群继续向北移动试图穿越深坑，更多的丧尸进入深坑内，丧尸的躯体将深坑逐渐填满。
一些丧尸听到头顶直升机飞过的声音，抬起头向机群看去，直升机的飞过并未吸引丧尸们太久，它们的注意力始终集中在前方。
隧道北侧的丧尸已经开始遭到撤退中的防御部队的阻击，在隧道中高bao炸药爆炸之前越过隧道的丧尸数量不多，大概数量只有几千。战士们在撤退中开始稳住队形，进行反击。时间和生命都在流逝，第一防线上撤下的战士们伤亡数量开始上升，隧道北侧正面的压力比之前要小了很多，士兵们依托地形边打边撤，第二道防线的战士也前突上来进行掩护。
最终成功退到第二防线的士兵有400多人，加上原本第二防线上的300人，一共不到800人，和最初第一防线的防御力量相当。
徐勇平继续接管第二道防线的指挥权，开始在防线附近区域布防。国家会议中心东面是仰山河，仰山河从奥海和洼里湖留出，一直向南延伸。徐勇平派人将横跨在仰山河上的几座桥全部爆破掉，让仰山河变成第二道防线东侧的天然屏障。国家体育场北路、大屯路、大屯北路和科荟南路上的几座桥相继在爆破中坍塌，桥上的车辆和桥体的钢筋水泥落入河中。四座桥梁被毁掉后，第二防线的正面被压缩到800米宽，每人的防御宽度在1米左右，比第一道防线的防御压力降低了一半。
之前在鸟巢东侧汇园公寓区域的尸群被隔绝在仰山河以东，数小时之内无法对防线以及研究所造成威胁。丧尸群中剩余丧尸的数量大概在6万左右，它们开始越过慧忠路隧道的深坑，进入到国家体育馆和奥体中心游泳馆附近的区域，距离第二道防线只有500米的距离。少量的丧尸偏离了方向，离开了丧尸群向西面移动，进入到科学园南里七区。
尸群中离开的丧尸给防御方增加了很大的变数，徐勇平只得派出一只50人的小分队前去盯住它们。61889部队目前抽调不出足够的力量去消灭这些离群的丧尸，被派出的小分队的任务就是观察丧尸的动向，及时向徐勇平部以及研究所预警。
国家会议中心前面的道路上都是半人高的路障，这些路障既可以作为守御部队的掩体，又可以阻挡丧尸群的推进。会议中心门前的三根旗杆上仍然飘扬着旗帜，中间的五星红旗格外的耀眼，许多战士都有意无意的向它望了几眼，心中的信念也更加坚定了几分。
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