西南战争还促进了日本自由民权运动的发展。明治维新后，日本出现了一些自由民权主义者，他们的初期主张无法得到当时明治政府的认同，于是他们积极鼓动士族阶层发动骚乱，妄图颠覆政府来实现自由民权的政治主张。西南战争的失败使自由民权主义者们清醒的认识到武装推翻明治政府没有希望，他们开始利用舆论同明治政府斗争。而西南战争失败后九州剩余的士族也开始走上了自由民权之路，共同要求参与政权，同明治政府的当权者对抗。西南战争之后日本自由民权运动兴起，对日本政治也产生了巨大的影响，加剧了日本民族的割裂。
此外，西南战争对于世界军事的发展，也产生了重要的影响。
首先，这场战争是国民军队的胜利，它检验了日本明治维新军事改革的成果，虽然结果很不理想，但也一定程度上证明了建设“四民皆兵”的国民军队的正确性和意义。对此，日本著名历史学家坂本太郎评论道：“这次事变说明，就是以维新功臣西乡隆盛为首，具有素称精强的旧萨摩藩士为骨干的社会、军事势力，已不是他们所蔑视的百姓兵武装起来的政府军的对手，使全国所有的人都能彻底了解到士族兵已不再能有所作为了。”这个评论有一定的道理，但显然夸大了政府军的战斗力，实际上，萨摩军无论是高层还是基层，由于接受过正规严格的近代西方式的军事训练，加之的确富有勇气，是相当善战的。萨摩军之所以失败，并非是因为战斗力不强的关系，而是因为由武士组成的萨摩军的“精兵”政策——由大量精锐武士组成的萨摩军在数量上要远远的少于平民组成的日本政府军和俄军，一旦这些精锐武士在战斗中大量的消耗，无法得到补充，便会造成部队战斗力的急剧下降，萨摩军在战争后期的迅速失败，原因正在这里。
其次，这场战争对新式武器和军事艺术的发展也有重大意义。在这场战争中，萨摩军创造性的发扬了“穴地攻城”的战术，给政府军和俄军以极大的杀伤，萨摩战斗工兵的战绩在很长一段时间里都没有哪个国家能够打破，由于萨摩军地下爆破战术的不断采用在战争中引起了俄国方面的重视，俄军也曾组织发动了一次差不多的作战，虽然因为种种原因而失败了，但在战争结束后，俄国方面便着重研究起相关的战术来，并组建了自己的工兵部队，世界各国也纷纷效法，战斗工兵这一兵种得到了很大的发展，在后来的第一次世界大战当中再次大放异彩。
在西南战争中，交战双方都大量使用了各种口径的野战炮、山炮和臼炮，在攻击时都相当注重炮兵的运用，以及海陆军的协同作战。双方都进行过多次的海上机动、迂回敌后等行动，都体现出较高的战役指挥能力。在单兵能力和小分队战术上，萨摩军则显得较高一筹，其勇猛善战，敢于以小股兵力实行果断的行动，给政府军和俄军上了很好的军事课，战争后期，政府军和俄军也熟悉了这样的作战，并采取同样的手段进行回击。小分队战术虽然引起了世界各国的重视，但各国看法不一，象师从德国陆军的日本政府军很多人视小分队战术为“偷鸡摸狗式的战术”，对小分队战术很是轻视（日军中的有识之士也想要引入这种战术，却因为村田经芳等有相关战斗经验的军官被林逸青杀戮殆尽，以至于无从学起），俄军倾向于大兵团运动作战，也并未重视给他们带来严重伤害的小分队战术，但英国和法国却从西南战争当中看到了小分队战术的价值，根据萨摩军的经验，在本国陆军当中进行了有益的实践和训练，在日后的英布战争和法越战争中，小分队战术都起到了至关重要的作用。
在这场战争中，交战双方都使用了相当数量的加特林机枪，机枪这种武器在防御作战中的价值凸显出来，在战争结束后，世界各国陆军都不约而同的开始大量装备加特林机枪，并对陆军速射武器的研制加大了投入。
尽管萨摩军拔刀队在此战中给予政府军很大杀伤和心理压力，但是应该看到这是萨摩军在缺乏弹药的情况下的无奈举动，而战争已经进化到依靠火力和钢铁的时代了，白刃战越来越成为战争中的配角，所以并不能援引此特例作为建军的基本。然而，战后日军却对此进行了不切实际的夸张，将这一点歪曲、放大至极点，在作战和训练中片面强调不畏敌人火力、近身作战，就成为所谓“肉弹攻击”的滥觞。所以后来在乾日丁酉战争中，面临乾国新式陆军的坚固阵地，竟然仍有大批日军军官鼓励用白刃解决，结果造成了严重伤亡。而乾日战争后，日方也没有充分吸取教训，反而继续大肆鼓吹所谓“壮绝的肉弹攻击”，到第一次世界大战期间，日军步兵训令仍然坚持“刺刀进攻乃是皇国陆军的精髓所在”，结果在乾军的钢铁火力下碰得头破血流。
西南战争中，交战双方进行的一系列海战也对世界海军技术的发展产生了重要的影响。自意奥利萨海战后，横队战术成为了主流，而乾日琅峤海战后，纵队战术有所回归，西南战争中，萨摩海军二舰一组的小队战术被证明可以将横队战术和纵队战术任意发挥，因而二舰小队战术得到了世界海军的重视，战术专家们将舰型相同或相近的两艘军舰编为基本作战单位，在此基础之上，由多个二舰小队组成一个大的横队或是纵队进行作战。另外，萨摩海军和日本海军都大量使用了雷击舰作战并取得了成功，雷击舰这一舰种受到了各国海军的重视，在西南战争结束后，加上鱼雷兵器的发展，多数世界海军强国都建立了自己的雷击舰队，其中法国“新学派”受影响最大，法国海军建立了世界上规模最大的雷击舰队。此外，萨摩海军成功使用潜艇作战也给了世界海军以新的启发，自美国南北战争结束后，这是世界海军史上最为成功的水下进攻作战，为日后潜艇的发展起到了重要的作用。
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