两月前，在得到李景授印以后，孙猛和孙传庭便开始调遣手下的部队，然后以郑芝龙舰队为主力，李国助和钟斌两部为侧翼封锁马尼拉湾。
驻守在马尼拉的西班牙人自然不愿被明军封锁出海的通道，当即尽遣驻守舰船出战。
不过西班牙人虽然也拥有不少舰船，但是无论是舰船数量还是士兵数量都不及当初的荷兰舰队，连荷兰舰队尚且在郑芝龙手中全军覆没，何论西班牙人？况且此时郑芝龙有装备了新式火炮的李国助和钟斌所部舰队配合，实力更是大增，与跟荷兰舰队交战时已不可同日而语。
马尼拉湾一战，郑芝龙令李国助和钟斌率领舰队两翼前插，依靠新式火炮的优势牵制西班牙舰船的注意力，然后故技重施，以一百余艘小型舰船做前锋突击队，俱备燃火之物，绕敌占据上风头之后迅速向西班牙舰队发起决死突击，抵近后纵火焚船。
在当时火炮很难击沉大型舰船的情况下，这种纵火攻击以及跳帮作战的方式确实是最快解决战斗的方法。
双方接战只半日，郑芝龙所部便焚毁西班牙大型舰船四艘，击沉中型舰船七艘，小型舰船二十余艘，眼见郑芝龙所部渐渐合围，西班牙人见势不妙迅速退出战斗。。
郑芝龙率部紧追不舍，西班牙人眼见摆脱不掉，最后无奈退回马尼拉，然后弃舰登岸，企图依靠马尼拉城据城死守。
郑芝龙所部迫近马尼拉城之后，迅速分兵，一部依旧在正面牵制马尼拉城内的西班牙守军，其余部队分两路分别从马尼拉城南北两个方向登陆，对马尼拉形成合围之势。
但是西班牙人在马尼拉城外建筑了多处据点，每处据点都列装了大量火炮。
郑芝龙所部打海战确是一把好手，但是陆战尤其是攻城战却非其所长。三路大军猛攻三日，皆无功而返。
眼见战事不利，孙传庭当即阻止郑芝龙继续攻城的行为，令郑芝龙派出军舰回福建接引孙猛所部前来增援。
数日后，孙猛率领陆战部队随舰船抵达马尼拉，未及休息，便即排开阵势，从正面向马尼拉城外发起炮击。
在铺天盖地的炮火轰击下，马尼拉城外西班牙人的据点被一个个拔除，眼见前方再无威胁，孙猛当即率领部队登陆，然后把数百门火炮分成数个梯队，向马尼拉城外南北两个方向施行炮击，然后层层推进。
两日后，孙猛所部与马尼拉城外南北两路明军会合，部队旋即向马尼拉城发起攻击，又一日，孙猛所部大军攻至马尼拉城下，将马尼拉团团包围。
李景接到孙猛送来这份战报的时候，距离孙猛将马尼拉包围已有月余。
对此，李景也是十分无奈，北京距离马尼拉上万里其中还隔着南海，信使坐船到距离马尼拉最近的广东也要三千多里，然后快马把消息送往京城，跑这一趟用时一个月都是快的。
不过随后，隔两三日便有战报送来，自是孙猛知道李景心念马尼拉的战事，隔两三日便派人往京城送信。
但是随后马尼拉战局突然出现了变故，这个变故不是明军攻不破马尼拉城，实在是明军把西班牙人打得太狠了，西班牙人眼见守不住了，菲律宾总督科奎拉竟然下令把城内的华人抓到城墙。
城墙上突然出现了明人，孙猛自然无法继续以火炮攻城。与孙传庭商议了一下，两人决定暂缓攻城，与西班牙人谈判。
可惜，这场谈判注定是无法谈拢的。
本来孙猛跟孙传庭商议，只要西班牙人放过城里的大明人，那么可以考虑放西班牙人一条生路，要知道，李景给孙猛下达的命令是把驻扎在吕宋的西班牙人斩尽杀绝的，孙猛和孙传庭答应放过这些西班牙人可以说是违背了李景的命令。违背李景的命令，孙猛和孙传庭可是冒着相当大的风险的。
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