灵帝慌忙同意了大臣们的应对方案，除了相信这些臣子，灵帝也没什么其他办法。
大将军何进率左右羽林五营士屯于都亭，整点武器，镇守洛阳，何进真正开始拥有了属于自己的军队，并牢牢控制了洛阳。为之后的争斗埋下了伏笔。
灵帝又下诏，自函谷关、大谷、广城、伊阙、轘辕、旋门、孟津、小平津等各京都关口，设置都尉驻防，原本位高权重的都尉，开始变得不值钱了。
再次下诏各地严防，命各州郡准备作战、训练士兵、整点武器、召集义军。刘备这样的草根人物，终于有了出头之日。
皇甫嵩上谏要求解除党禁，拿出皇宫钱财及西园良马赠给军士，提升士气。现在江山都快保不住了，钱财什么，灵帝就觉得不是那么重要的，至于解除党禁，灵帝也不当一回事，自己是天下之主，巴不得全天下的人为自己抛头颅洒热血。灵帝十分英明地接纳提案，大赦党人，发还各徙徒。并要求各公卿捐出马、弩，推举众将领的子孙及民间有深明战略的人到公车署接受面试。解除党禁，就是在打十常侍的脸，十常侍们也是敢怒而不敢言，心中把皇甫嵩给记恨上了。
何进展露出高人一等的军事能力，派出多路精兵镇压各地乱事。卢植领副将宗员率北军五校士负责北方战线，与张角主力周旋。皇甫嵩及朱儁各领一军，控制五校、三河骑士及刚募来的精兵勇士共四万多人，讨伐颍川一带的黄巾军。
汉军做好了充足的计划，开始镇压黄巾党。可是已成气候的黄巾党，可不是那么好对付的。
汉军在首战并未得利。朱儁军就被黄巾波才所败而撤退，皇甫嵩唯有与他一起进驻长社防守，被波才率大军围城，汉军人少，士气低落。
又汝南黄巾军在邵陵打败太守赵谦，广阳黄巾军杀死幽州刺史郭勋及太守刘卫，黄巾军并未因汉室的动作而有败退的迹象。
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